16th KOGO conference 2007

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The 16th <st1:country-region w:st="on"><st1:place w:st="on">Korea</st1:place></st1:country-region> Genome Organization Conference<o:p></o:p>

KOGO 2007 Annual Meeting<o:p></o:p>

September 13-14, 2007<o:p></o:p>

<st1:placename w:st="on">Seoul</st1:placename> <st1:placename w:st="on">National</st1:placename> <st1:placetype w:st="on">University</st1:placetype>, <st1:place w:st="on"><st1:city w:st="on">Seoul</st1:city>, <st1:country-region w:st="on">Korea</st1:country-region></st1:place><o:p></o:p>

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Meeting Title : Omics to Industry <o:p></o:p>


I. Plenary Lecture 구성 <o:p></o:p>

PL 1: Prof. Sumio Sugano(<st1:place w:st="on"><st1:city w:st="on">University of Tokyo</st1:city>, <st1:country-region w:st="on">Japan</st1:country-region></st1:place>) <o:p></o:p>

“ Comparative study of alternative promoters of human and mouse genes. ”<o:p></o:p>

PL 2: Prof. Sue Rhee(Carnegie Institution, Stanford, U.S.A)<o:p></o:p>

“ Developing and exploring systems biological approaches to unravel how plants respond to environmental stresses. ”<o:p></o:p>

PL 3: Dr. Koichi Kawakami(National Institute of <st1:place w:st="on"><st1:city w:st="on">Genetics</st1:city>, <st1:country-region w:st="on">Japan</st1:country-region></st1:place>) <o:p></o:p>

Transposon-mediated gene and enhancer trapping in zebrafish.

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II. Symposium Session 구성 <o:p></o:p>

S1. Medical Genomics                            Organizer & Chair : <st1:personname w:st="on">오범석</st1:personname> 박사님<o:p></o:p>

- 발표 연사 1 : Alan F. Scott 박사님(존스홉킨스 의대)<o:p></o:p>

 Trend in high-throughout genotyping for disease association studies<o:p></o:p>

- 발표 연사 2 : <st1:personname w:st="on">정연준</st1:personname> 박사님(가톨릭대학교)<o:p></o:p>

  Whole-genome CNV profile of Koreans: the valuable Resource for disease association studies<o:p></o:p>

- 발표 연사 3 : <st1:personname w:st="on">이종영</st1:personname> 박사님(국립보건연구원)<o:p></o:p>

Whole-genome association studies with the type 2 diabetes mellitus using the STR markers<o:p></o:p>

-         발표 연사 4 : <st1:personname w:st="on">이민구</st1:personname> 박사님(연세대학교)<o:p></o:p>

  Genetic Variations of ABC Transporters in Korean<o:p></o:p>

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S2. Plant Functional Genomics and Mushroom <o:p></o:p>

Organizer:<st1:personname w:st="on">박범석</st1:personname> 박사님/ Chair : <st1:personname w:st="on">김호일</st1:personname> 박사님 <o:p></o:p>

- 발표 연사 1 : 공원식 박사님(농업과학기술원) <o:p></o:p>

 Studies on Structural and Functional Genomics of Winter Mushroom, Flammulina velutipes<o:p></o:p>

- 발표 연사 2 : <st1:personname w:st="on">임명호</st1:personname> 박사님(농업생명공학연구원)<o:p></o:p>

 Transcriptome Profiling of Developing Brassica Using KBGP-24K Microarray<o:p></o:p>

- 발표 연사 3 : <st1:personname w:st="on">남백희</st1:personname> 박사님(명지대학교)<o:p></o:p>

- 발표 연사 4 : <st1:personname w:st="on">안진흥</st1:personname> 박사님(포항공과대학교) <o:p></o:p>

Rice functional genomics by T-DNA insertional mutagenesis<o:p></o:p>

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S3. Statistical Genetics and Genomics                 Organizer & Chair : <st1:personname w:st="on">박태성</st1:personname> 박사님 <o:p></o:p>

- 발표 연사 1 : <st1:personname w:st="on">이은경</st1:personname> 박사님(마케팅랩) <o:p></o:p>

A tool for the exploratory multivariate analysis of systems biology data<o:p></o:p>

- 발표 연사 2 : <st1:personname w:st="on">김호</st1:personname> 박사님(서울대학교)<o:p></o:p>

   Design and Analysis of Genetic Twin Studies <o:p></o:p>

- 발표 연사 3 : <st1:personname w:st="on">이승연</st1:personname> 박사님(세종대학교)<o:p></o:p>

 Log-linear model based multifactor dimensionality reduction method to detect gene-gene interactions<o:p></o:p>

- 발표 연사 4 : 김진흠 박사님(수원대학교)<o:p></o:p>

일배체형에 기초한 고혈압과 AGT 유전자의 연관성 분석<o:p></o:p>

- 발표 연사 5 : <st1:personname w:st="on">강선정</st1:personname> 박사님(삼성생명과학연구소) <o:p></o:p>

What SNP genotyping errors are most costly for genetic association studies <o:p></o:p>

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S4. Proteomics                        Organizer:<st1:personname w:st="on">남명진</st1:personname> 박사님/ Chair : <st1:personname w:st="on">박영목</st1:personname> 박사님 <o:p></o:p>

- 발표 연사 1 : <st1:personname w:st="on">이봉희</st1:personname> 박사님(가천의대)<o:p></o:p>

   Stem cell proteomics<o:p></o:p>

- 발표 연사 2 : 성제경 박사님(서울 수의대)<o:p></o:p>

 Proteomics in animal model<o:p></o:p>

- 발표 연사 3 : <st1:personname w:st="on">남명진</st1:personname> 박사님(가천의대)<o:p></o:p>

Discovery of cancer biomarker<o:p></o:p>

- 발표 연사 4 : <st1:personname w:st="on">설동근</st1:personname> 박사님(고려대학교)<o:p></o:p>

Development of low molecule weight human plasma proteins<o:p></o:p>

- 발표 연사 5 : <st1:personname w:st="on">강인철</st1:personname> 박사님(호서대학교)<o:p></o:p>

Protein Chip-Based Proteomics Research<o:p></o:p>

S5. Bioinformatics/Systems Biology                 Organizer & Chair : <st1:personname w:st="on">이상혁</st1:personname> 박사님<o:p></o:p>

-         발표 연사 1 : Prof. Hsuan-Cheng Huang(National Yang-Ming University, Taiwan)<o:p></o:p>

    Essential core of protein interaction network<o:p></o:p>

-         발표 연사 2 : <st1:personname w:st="on">윤석준</st1:personname> 박사님(숙명여자대학교)<o:p></o:p>

    Gene-specific large scale analysis of microarray gene expression data<o:p></o:p>

 - 발표 연사 3 : 최선심 박사님(강원대학교)<o:p></o:p>

    Analyses of the human genome through evolutionary genomics<o:p></o:p>

- 발표 연사 4 : 김희발 박사님(서울대학교)<o:p></o:p>

   Identification of domestication genes in animals, plants, and microbes<o:p></o:p>

- 발표 연사 5 : <st1:personname w:st="on">황대희</st1:personname> 박사님(포항공과대학교)<o:p></o:p>

    A systems medicine approach to complex diseases: its application to prion disease<o:p></o:p>

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S6. Pharmacogenomics and toxicogenomics associated with human disease and personalized therapy                              Organizer & Chair : <st1:personname w:st="on">신재국</st1:personname>박사님<o:p></o:p>

- 발표 연사 1 : <st1:personname w:st="on">박지영</st1:personname> 박사님(고려대학교)<o:p></o:p>

   Clinical Relevance of CYP3A5 Pharmacogenetics<o:p></o:p>

- 발표 연사 2 : <st1:personname w:st="on">이상섭</st1:personname> 박사님(인제대학교)<o:p></o:p>

   Pharmacogenetics of nuclear receptors  <o:p></o:p>

- 발표 연사 3 : <st1:personname w:st="on">김주한</st1:personname> 박사님(서울대학교)<o:p></o:p>

Bioinformatics methods for genotoxicity evaluation and carcinogenecity<o:p></o:p>

- 발표 연사 4 : <st1:personname w:st="on">윤석주</st1:personname> 박사님(한국화학연구원) <o:p></o:p>

Toxicogenomics for genomic biomarker discovery<o:p></o:p>

S7. New Technologies in Genome Research (Solexa, Roche, etc)  <o:p></o:p>

Organizer & Chair : <st1:personname w:st="on">김종일</st1:personname> 박사님 <o:p></o:p>

-         Macrogen Inc.<o:p></o:p>

-         Roche Diagnostics <st1:country-region w:st="on"><st1:place w:st="on">Korea</st1:place></st1:country-region><o:p></o:p>

-         BMS<o:p></o:p>

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S8. Microbial Genomics –Sequences to Systems<o:p></o:p>

  Organizer:<st1:personname w:st="on">김지현</st1:personname> 박사님/ Chair : 김선창 박사님, 이용환 박사님 <o:p></o:p>

- 발표 연사 1 : <st1:personname w:st="on">김지현</st1:personname> 박사님(한국생명공학연구원)<o:p></o:p>

             Omics analysis and experimental evolution of Escherichia coli B

- 발표 연사 2 : <st1:personname w:st="on">김희남</st1:personname> 박사님(고려대학교)<o:p></o:p>

Pathogenomics, virulence, and antivirulence of Burkholderia species

- 발표 연사 3 : <st1:personname w:st="on">김익상</st1:personname> 박사님(서울대학교)<o:p></o:p>

쯔쯔가무시병균 Orientia tsutsugamushi 유전체 해독 병원성 분석<o:p></o:p>

- 발표 연사 4 : <st1:personname w:st="on">허광래</st1:personname> 박사님(한국생명공학연구원) <o:p></o:p>

Construction of systematic deletion mutants of fission yeast and its applications  <o:p></o:p>

9. Functional Genomics in Animal Models<o:p></o:p>

Organizer & Chair : <st1:personname w:st="on">김철희</st1:personname> 박사님<o:p></o:p>

- 발표 연사 1 : <st1:personname w:st="on">박해철</st1:personname> 박사님(고려대학교) <o:p></o:p>

 Neural stem cell research in zebrafish<o:p></o:p>

- 발표 연사 2 : <st1:personname w:st="on">이한웅</st1:personname> 박사님(연세대학교)<o:p></o:p>

   Asc-2 is implicated in dilated cardiomyopathy<o:p></o:p>

- 발표 연사 3 : <st1:personname w:st="on">박승우</st1:personname> 박사님(연세대학교)<o:p></o:p>

   Towards establishment of zebrafish pancreatic cancer model for small molecular      drug screening<o:p></o:p>

- 발표 연사 4 : <st1:personname w:st="on">이원재</st1:personname> 박사님(이화여자대학교)<o:p></o:p>

   The in vivo value of gut immune regulation in Drosophila<o:p></o:p>

-         발표 연사 5 : <st1:personname w:st="on">이준호</st1:personname> 박사님(서울대학교)<o:p></o:p>

   Functional genomics in C. elegans<o:p></o:p>

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S10. Oral Presentation of Poster Session (포스터 중 선별된 연구주제): organizer-학술 (이종극&김영주학술위원)<o:p></o:p>

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III. Biginner’s Genomic Tools Workshop : 별도 등록 <o:p></o:p>

1. Introduction to Biostatistics : <st1:personname w:st="on">박태성</st1:personname> 교수님 <o:p></o:p>

2. Genomic Sequencing & Microarray : <st1:personname w:st="on">임용표</st1:personname> 교수님 <o:p></o:p>

3. Functional screeninghuman genes in zebrafish : <st1:personname w:st="on">김철희</st1:personname> 교수님 <o:p></o:p>

4. Introduction to SNPs : <st1:personname w:st="on">김영주</st1:personname> 박사님 <o:p></o:p>

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기타 : Poster Viewing Session (매일 오후 3-<st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="0" hour="16">4</st1:time>: 1시간) <o:p></o:p>

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IV. Industry Workshop <o:p></o:p>

1. Industry Workshop A: Seoulin Bioscience, Co. <o:p></o:p>

2. Industry Workshop B: DNA- Link, Co. <o:p></o:p>

3. Industry Workshop C: BIONEER, Co.<o:p></o:p>

4. Industry Workshop D: The <st1:place w:st="on"><st1:placename w:st="on">Korean</st1:placename> <st1:placename w:st="on">BioInformation</st1:placename> <st1:placetype w:st="on">Center</st1:placetype></st1:place> <o:p></o:p>

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September 13 (THU) , 2007<o:p></o:p>


Hall A<o:p></o:p>

Hall B<o:p></o:p>


<st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="30" hour="8">8:30</st1:time> - <st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="20" hour="10">10:20</st1:time><o:p></o:p>

Education Session 1. <o:p></o:p>

Introduction to Biostatistics<o:p></o:p>

Education Session 2<o:p></o:p>

Genomic Sequencing & Microarray<o:p></o:p>

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<st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="30" hour="10">10:30</st1:time> - <st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="40" hour="10">10:40</st1:time><o:p></o:p>

Opening Ceremony<o:p></o:p>

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<st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="40" hour="10">10:40</st1:time> <st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="30" hour="12">12:30</st1:time><o:p></o:p>

S1 <o:p></o:p>

Medical Genomics<o:p></o:p>


Plant Functional Genomics and Mushroom<o:p></o:p>

<st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="30" hour="12">12:30</st1:time> - <st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="30" hour="13">13:30</st1:time><o:p></o:p>


서린 바이오사이언스 Workshop <o:p></o:p>


DNA- Link Workshop<o:p></o:p>

<st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="30" hour="13">13:30</st1:time> – <st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="30" hour="14">14:30</st1:time><o:p></o:p>

PL1 : Dr. Sumio Sugano<o:p></o:p>

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<st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="30" hour="14">14:30</st1:time> – <st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="0" hour="16">16:00</st1:time><o:p></o:p>


Statistical Genetics and Genomics <o:p></o:p>



<st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="0" hour="16">16:00</st1:time> – <st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="0" hour="17">17:00</st1:time><o:p></o:p>

Poster Viewing Session  & Coffee Break<o:p></o:p>

Poster Viewing Session  & Coffee Break<o:p></o:p>

Poster Open<o:p></o:p>

<st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="0" hour="17">17:00</st1:time> - <st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="30" hour="18">18:30</st1:time><o:p></o:p>



Systems biology <o:p></o:p>


Pharmacogenomics and toxicogenomics associated with human disease and personalized therapy <o:p></o:p>

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<st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="30" hour="18">18:30</st1:time> – <st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="30" hour="19">19:30</st1:time><o:p></o:p>


<o:p> </o:p>

Registration: <st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="0" hour="8">8:00</st1:time>-<st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="0" hour="12">12:00</st1:time> <o:p></o:p>

September 14 (FRI), 2007<o:p></o:p>


Hall A<o:p></o:p>

Hall B<o:p></o:p>


<st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="30" hour="8">8:30</st1:time> - <st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="20" hour="10">10:20</st1:time><o:p></o:p>

Education Session 3. <o:p></o:p>

Functional screening of human genes in zebrafish  <o:p></o:p>

Education Session 4. <o:p></o:p>

Introduction to SNPs <o:p></o:p>

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<st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="30" hour="10">10:30</st1:time> - <st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="30" hour="11">11:30</st1:time><o:p></o:p>

PL2: Dr. Sue Rhee <o:p></o:p>

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<st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="30" hour="11">11:30</st1:time> – <st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="0" hour="13">13:00</st1:time><o:p></o:p>


New Technologies in Genome Research<o:p></o:p>


Microbial Genomics <o:p></o:p>

–Sequences to Systems<o:p></o:p>

<st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="0" hour="13">13:00</st1:time> - <st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="0" hour="14">14:00</st1:time><o:p></o:p>


Bioneer Workshop<o:p></o:p>


국가생물자원정보관리센터 Workshop<o:p></o:p>

<st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="0" hour="14">14:00</st1:time> – <st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="0" hour="15">15:00</st1:time><o:p></o:p>

PL3 : Dr. Koichi Kawakami<o:p></o:p>

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<st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="0" hour="15">15:00</st1:time> – <st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="0" hour="16">16:00</st1:time><o:p></o:p>

Poster Viewing Session  & Coffee Break <o:p></o:p>

Poster Viewing Session  & Coffee Break <o:p></o:p>

Poster Open<o:p></o:p>

<st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="0" hour="16">16:00</st1:time> – <st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="30" hour="17">17:30</st1:time><o:p></o:p>


Functional Genomics in <o:p></o:p>

Animal Models<o:p></o:p>


Oral presentation of poster session<o:p></o:p>

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<st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="30" hour="17">17:30</st1:time> - <st1:time w:st="on" o:ls="trans" minute="0" hour="18">18:00</st1:time><o:p></o:p>

Ceremony for Poster Awards and Closing Remarks<o:p></o:p>

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Plenary Lecturer: 1 hour including 50 min for talk and 10 min for question and answer <o:p></o:p>

Symposia: 25 min for foreign speakers, 15 min for domestic speakers


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